یکی از اصلی‌ترین چالش‌های مسیر پرپیچ‌وخم ثبت اختراع در ایران، زمانبر بودن این فرآیند است که این مهم مرتبط با اداره ثبت اختراعات و مالکیت فکری زیر نظر قوه قضائیه می‌باشد. بسیاری از مخترعان از زمانبر بودن این مسیر گله‌مندند و زمان حدودی رسیدگی به فرآیند ثبت درخواست خود را دو سال بیان می‌کنند که درنهایت باعث تغییر مقصد ثبت اختراع برای آنان خواهد شد و آنان مجبور به ثبت اختراع خود در خارج از کشور می‌شوند.

حدود‌86‌درصدازمالکان اختراعات‌اشخاص‌حقیقی هستندوتنها‌14‌درصد‌باقی‌مانده‌را‌اشخاص‌حقوقی - شامل شرکت‏ها، دانشگاه‏ها و پژوهشگاه‏ها- تشکیل‌می‏‌دهند.

نمایندگان مجلس مقرر کردند تا اعتراض به تقاضای ثبت اختراع و پذیرش اظهارنامه باید به صورت کتبی در دو نسخه به مرجع ثبت ارائه شود.