دکتر علی‌اکبر ولایتی، مشاور مقام‌معظم‌رهبری در امور بین‌الملل در پی ترور نخست‌وزیر سابق ژاپن، با درج یادداشتی در دفتر یادبود وی که در سفارت این کشور در ایران بازگشایی شده بود ضمن محکومیت این اقدام، این ضایعه تاسف‌بار را به ملت بزرگ ژاپن تسلیت گفت.
او در بخشی از این یادداشت نوشته است: «یقینا مردم ژاپن خدمات وی را فراموش نخواهند کرد.  اینجانب با شادروان آبه شینتارو در زمان تصدی وزارت امور خارجه، روابط دوستانه و نزدیکی را برقرار کردیم. آشنایی با ایشان در زمان تصدی در وزارت خارجه که به دعوت اینجانب به تهران آمده بود صورت گرفت و اولین دیدار رسمی میان مقامات رده‌بالای دو کشور پس از پیروزی انقلاب اسلامی ایران انجام شد و متعاقب آن سفر اینجانب به توکیو مقدمه‌ای برای توسعه روابط دو کشور بود.» ‌
دکتر ولایتی با اشاره به بمباران اتمی در ناکازاکی و هیروشیما تاکید کرد: «مردم ژاپن هنوز تبعات ناشی از جنایت جنگی بمباران اتمی در جنگ جهانی دوم توسط آمریکا را فراموش نمی‌کنند و پایداری و سختکوشی ملت ژاپن برای سایر کشورها الگو است.»
وی در پایان تصریح کرد: «امیدوارم روابط جمهوری اسلامی ایران با دولت و ملت ژاپن که مشکلات ناشی از جنگ را پشت‌سر گذاشته‌اند و ازجمله پیشگامان علم و صنعت در دنیا هستند، هر روز تعالی بیشتری یابد.»