کتاب جدید خاطرات هاشمی رفسنجانی که مربوط به سال ۸۰ است، در بخشی که او اتفاقات ریاست جمهوری را شرح می‌دهد، می‌گوید، با نظر رهبری، خاتمی تایید صلاحیت شد و می‌نویسد: «شورای نگهبان حاضر نبود صلاحیت آقای خاتمی را تایید کند و با نظر ایشان (رهبر انقلاب) رای دادند.»