متن پیام رهبر انقلاب اسلامی به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
انا لله و انا الیه راجعون
خبر ارتحال عالم بزرگوار و خدوم مرحوم حجت‌الاسلام والمسلمین جناب حاج شیخ محسن علی نجفی طابَ ثَراه موجب تاثر و تاسف گردید.
اینجانب فقدان این عالم محترم را به علماء و حوزه‌های علمیه پاکستان، خانواده و دوستداران ایشان مخصوصاً شیعیان محترم «بَلتِستان» تسلیت گفته و از خداوند شکور برای این عالم وارسته غفران واسعه و علو درجات و برای بازماندگان محترم صبر و اجر مسئلت دارم.
والسلام علیکم و رحمةُ اللهِ و برکاتُه
سیدعلی خامنه‌ای
۲۰ دی ماه ۱۴۰۲
آیت‌الله محسن علی نجفی از علماء و مفسران برجسته شیعه در پاکستان بود که تحصیلات خود را در نجف و در محضر اساتیدی همچون مرحوم آیت‌الله خوئی و شهید آیت‌الله محمد باقر صدر گذراند. وی موسس حوزه‌های علمیه «جامعةُ اهلُ‌البیت» و «جامعةُ الکوثر» و رئیس شورای عالی مجمع اهل‌البیت علیهم‌السلام در پاکستان و بنیانگذار سیستم آموزشی اسوه و چند دانشکده خصوصی در این کشور بود.