چندی پیش در حالی که نیروهای آل خلیفه به خانه شیخ عیسی‌قاسم حمله کرده بودند، شهروندان بحرینی ساکن در این منطقه به خیابان‌ها آمدند و میان آنها و نیروهای امنیتی این کشور درگیری‌هایی ایجاد شد. گفته می‌شود در این تجمع بیش از دو نفر از معترضان بازداشت شدند. نیروهای آل خلیفه همچنین اعضای خانواده آیت‌الله را با خود بردند و هنوز کسی از محل اقامت رهبر شیعیان بحرین با خبر نیست. در میانه این تنش‌ها در حالی که عربستان‌سعودی از عملکرد نیروهای امنیتی بحرین از شیعیان حمایت کرده بود، سازمان عفو بین‌الملل طی بیانیه‌ای اعلام کرد که به اسناد و مدارکی دست یافته که نشان می‌دهد نیروهای امنیتی آل خلیفه از زور استفاده کردند و برای پراکنده کردن تظاهرات کنندگان به گاز اشک‌آور متوسل شده‌اند. این نهاد بین‌المللی خواهان انجام تحقیقات مستقل و محاکمه کسانی شد که به چنین سرکوب گسترده‌ای دست زدند. بحرین از سال 2011 موجی از تنش‌ها و ناآرامی‌ها را تجربه کرد، نیروهای آل خلیفه از همان ابتدا با کمک عربستان‌سعودی دست به سرکوب گسترده معترضان زد و سیاست‌های سرکوب گرایانه‌اش موجی از انتقادها را به دنبال داشت. بسیاری از تحلیلگران از بحرین تحت عنوان حیاط خلوت ریاض یاد می‌کنند. به همین دلیل عربستان با بروز هرگونه تنشی در این منطقه به کمک نیروهای آل خلیفه می‌شتابد، چراکه نمی‌خواهد در دو کشور درگیر شود.
در این میان شیعیان به‌عنوان اقلیت ساکن در این منطقه بارها توسط حامیان آل خلیفه مورد تبعیض قرار گرفتند و از بسیاری از حقوق‌شان محروم شدند. محاکمه‌ آیت‌الله عیسی‌قاسم نیز با هدف سرکوب اقلیت شیعه و اعمال محدودیت‌های بیشتری علیه این گروه ساکن در بحرین صورت گرفت.